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一种快速鉴定窖泥中甲烷囊菌的酶切方法
添加时间:2022-11-03 浏览次数: 548

专利号:2018109295374

本发明属于生物技术领域,涉及一种快速鉴定窖泥中甲烷囊菌(Methanoculleus)的酶切方法,该方法包含以下步骤:(1)将窖泥中含量最高的30个优势菌属与甲烷囊菌属的16S rDNA全长序列分别进行MAFFT比对,找出各属的代表性序列2‑4个;(2)各属代表性序列的酶切分析,从中找出来甲烷囊菌16S rDNA全长序列的特征性酶切方式3‑10种;(3)在全部30个优势菌属与甲烷囊菌属的16S rDNA全长序列中逐一验证上述3‑10种特征性酶切方式。(4)经过确认的特征性酶切方式再进行实验验证。(5)最终确认至少一种甲烷囊菌16S rDNA全长序列的特征性酶切方式用于窖泥厌氧培养过程中菌落的快速鉴定。本发明可达到从窖泥厌氧菌群中快速识别甲烷囊菌属细菌的目的,比起常规测序鉴定节省大量时间。

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